团的结构是固定的，不利于战场上灵活用兵，不利于优化兵种合成，而且不利于战损部队的快速补充。
以兵力补充为例，团的两个建制营打残了进行整补，另外两个完整的营则不得不坐着干等。若战场急需使用这两个完整的营，就不得不打乱团的建制，从而带来指挥和人事上的诸多问题。
此外，新老各部队武器装备五花八门，后勤供给参差不齐，训练水平高低不同，家丁、在营家丁、营兵、卫所军、辅兵的身份彼此不同，各级将领没有经过系统的学习和培训，使各部队战斗力完全无法用统一的标准去衡量，这对未来大规模的多单位多军兵种的联合作战极为不利。
因此，军机处和参谋部根据世子改革和统一护国军野战部队编制的重要旨意，根据未来的作战样式，参考历朝历代军制的优劣，按照“统一、联合、模块”三大标准，制定了护国军陆军野战旅崇祯十五年式编制。
新成立的陆军步兵第一、二、三、四、五、六、七旅，将全部按照该编制进行统一编成。
骑兵不同于步兵，官兵比例远大于步兵。其编制尚在制定完善，很快也会颁布。
舒国平还指出，实战证明：改装备必须改编制，改编制必须兵种联合。
步、骑、炮、工、缁各兵种联合协同作战，可以使同等数量军队的战斗力大幅提高。
火铳、火炮等新式火器的大规模装备使用，使护国军的攻坚野战能力均大幅领先于同等数量的大明官军。
因此，在提高军队的火器化水平的基础上，促进护国军的合成化、模块化，是此次编制改革的重中之重。
在崇祯十五年式编制中，一个步兵旅下辖旅部及旅部连、三个步兵团部及团部连、十个步兵营、一个骑兵营、一个炮兵营、一个辎重营、一个侦察连、一个通信连、一个纠察连、一个军械连、一个营级军医院及担架队，共二十二个单位，满
编共约一万一千人。
模块化，就是以这标准化的二十二个单位作为基础模块。
旅、团两级指挥机构，可以根据作战需要，对所辖二十二个模块进行组合、拆分，进行灵活的任务编组。这样，既避免了临时编成方式中“将不知兵，兵不知将”的毛病，也避免了固定编制方式死板僵化的缺点。
合成化，就是小到连，大到旅，在各级编制中进行兵种合成。进而通过兵种合成，大幅度提高部队遂行作战任务的能力。
按照陆军步兵旅崇祯十五年式编制，七个步兵旅共需步兵营七十个、炮兵营、辎重营各七个。但由于护国军兵力缺乏，因此这七个旅都暂时缺编。
目前，已经编成的十六个野战步兵团，除谭思贵第三团超编一个步兵营，刘镇藩第十一团超编一个骑兵营，冯如虎的第八团和贾登联第十四团满编之外，其余各团均未达到四个步兵营的标准编制。
个别的团，如王祥的第十三团甚至仅有一个营。
炮兵营、骑兵营、工兵营的数量更是严重不足，尤其是必不可少的马匹短缺。
因此，目前新编各旅一律只编入六个满编步兵营，缺额的四个营待第一批组建的架子营成军后抽调补足。各新编旅所辖骑、炮、工三营同样只能先编入约两个连，营炮连先编入两个排，人员、装备和马匹的缺额将来再补。
至于这七个旅的部署，舒国平强调，必须部署到对未来战局关系最大的主要方向上去。
初步的计划，是川北军区、川南军区、夷陵军区和澧州军区各兼一个旅。剩下的三个旅和骑兵部队由眉州城下的诸单位编成，在松林山基地编组集训，作为世子亲自指挥的机动力量。
将来战事开启，世子一声号令，这三个旅便集结成师，开赴沙场。
原来，我们这些人只能编上三个旅啊！新人们不免失望。
不过呢，有三旅九团五十四个步营的番号，上位的机会也是不小！
一些新人迅速盘算着，同时掂量自己在世子心目中的分量。
还有些新人没有这么多深邃的花花肠子。他们急不可耐的，便是孙先生迅速出场，把兜里那份任职名单赶快读了，省得大家伙心慌。
只有个别新人，悄无声息坐在人群之中，铁青着脸，不知在冥想些什么。
可世上的事总是那么奇怪，你越盼什么，什么越不来。
舒国平刚刚下去，同他坐一根凳子上的中年将官便站了起来。他不慌不忙从军服的兜里掏出一个小本本，走上台阶先向世子敬了个军礼，待到世子颔首示意，这才缓缓转过身来，把本本慢慢翻开。
“兵法云：兵马未动，粮草先行。兵法又云：军无粮则乱，兵无饷则散。
世子曾言于末将：打仗打的是什么？打的不是刀枪长矛，打的不是火铳大炮，打的是粮食、是军饷、是源源不断的后勤补给！
松山城洪承畴困据小城，缺粮短饷，结果是众叛亲离朱仙镇左平贼断水阵前，结果又是诸军大溃！
汴京围城三匝，已经濒临绝境孙白谷整军关中，使得富家多破，贫家更残。
以粮饷观之，朝廷粮匮饷乏，恐气数已尽矣！”
说到此处，阶上的中年将官用翻开的小本本，隔着空气对着阶下的将领们轻轻一扫。
此人相貌温文尔雅，说话轻言细语，一番入木三分的评论，却似惊雷盖顶，震撼全场。
有护国军老人立即向众多打听者说明了主讲者的身份。
原来，这位中年将官便是原总后勤部的部长吴泰。
别看吴部长并不喜欢抛头露面，他可是在松林山整军前加入的护国军老人！
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