四百多年后，旅行者空来到了枫丹，他遇到了由玛丽安和莉莉丝融合后又分离出来的安。
安告诉旅行者，为了拯救莉莉丝公主，她需要旅行者的帮助。
但安不知道的是，她和旅行者最终要找的玛丽安和她本为一体的。
安是玛丽安的梦中人，是她通过想象分离的个体。
简单来说，可以把安看成是阿兰的妹妹玛丽安，然后把安眠处的玛丽安看成院长莉莉丝。
不过严格来说，这个对应关系是错的。
因为融合后再分离出来的个体，并不是原来的那个个体，这就是融合的代价。
一旦进行融合，原本的那个存在将变得模糊，从融合中分离出来的个体都是新的个体，只是带有原来那些人的信息，可能他们有倾向于融合前的某个人的特征，但绝不是那个人本体。
空在安的指引下进入了纯水精灵盘踞的高塔，这个高塔所通往的地方其实是玛丽安的回忆，是玛丽安通过想象改造猴的水仙十字院。
在那里，他们见到了水仙十字圣剑。
这把剑虽然是一把木剑，但安却说真正的水仙十字圣剑拥有斩断精神与意志的能力，要通往水仙十字院的终点就需要这把剑。
在安引路下，他们最后见到了沉眠处的玛丽安。
玛丽安对两人的到来非常排斥，她希望她分离出来的安拥有自己的灵魂，自己的记忆，而不是变为曾经的玛丽安或者莉莉丝。
最终玛丽安赶走了他们，将自己闭锁在沉眠处的庄园里。
安不理解玛丽安地行为，但她想要得到更多的信息，她打算留在安眠处探寻一番。
而在厄里那斯体内，旅行者见到了西摩尔，阻止了雅各布再次活化厄里那斯。
在梅洛彼得堡，旅行者见到了卡特皮拉，帮助他越狱。
在安眠处，旅行者见到了安，最终安、卡特皮拉、西摩尔聚集于水仙十字结社。
众人一同取得了四象限，击败雅各布，锻造出了“理性之圣剑”——水仙十字圣剑。
水仙十字圣剑同时拥有切割和融合精神意志的能力。
在格式塔的底层，空了解了雷内计划的全貌。
雷内计划在原始胎海溶解所有枫丹人时，打造圣剑，利用自身获得的强大力量融合所有枫丹人的意志，以此获得足以匹敌整个世界的位格。
如果枫丹的原始胎海没有上涨，他将会亲自打开位于格式塔底层的原始胎海第二处决口，溶解所有枫丹人。
这就是雅各布在剧情里做的事：逆转“密合之契阵”，强行破开原始胎海的封印，让胎海水淹没枫丹。
然后，他将会以此强大的位格直面吞噬了胎海水的吞星之鲸，并将其击败。
在原始胎海之中度过的四百余年时间，雷内用尽自己的全部力量维持自我，并以自己的精神构建了一个全新的、只存在于自己脑海中的宇宙。
在旅行者进入原始胎海后，纳齐森科鲁兹被唤醒。
他发现枫丹的原始胎海并没有如预言般上涨，于是他决定透支自己的生命来容纳更多枫丹人的意志。
但水仙十字圣剑拥有分离精神的力量，旅行者利用圣剑，将纳齐森科鲁兹的精神力量不断削去。
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