刘牢之摇头不语，当军兵再次来报时，谯王司马尚之大败而逃。
刘牢之不顾手下众将反对和劝谏，对他们说，我怎能不知道这些！我今天消灭桓玄，易如反掌，但是，扫平桓玄之后，你让我如何对付骠骑大将军司马元显？
他最终决定投靠桓玄，派儿子刘敬宣前往姑熟桓玄营中请降。
三月初三，还在石头城外的朝廷水师战船上与众将士纸上谈兵，商讨抵御荆州军的司马元显，忽然接到探报，荆州军已经到了新亭（今江苏南京市雨花台区软件大道西）。
司马元显吓得魂飞魄散，赶忙下了战船，逃回建康城内。
在台城组织建康驻军防守，列阵于宣阳门外。
但平时司马元显对待军兵层层盘剥克扣，供给他们最低劣的饮食和被褥，不得军心，当听说荆州军前锋已抵达朱雀航，耳中听到震天高呼声，“缴械不杀，投降不杀！”
朝廷的军兵一哄而散，兵器丢得遍地都是。
十几年来司马道子谗佞专权，结党营私，祸乱朝纲，满眼望去大晋朝堂文臣武将尽是阿谀奉承，滥竽充数之辈，一看桓玄大军开进建康早跑的无影无踪。
光杆儿司令司马元显只好策马逃亡会稽王府，去找老爸司马道子去了。
正在酣睡中的司马道子被吓醒，揉着惺忪的双眼看着眼前惊慌失措的儿子，听闻建康被桓玄攻陷，大势已去，父子二人抱头痛哭。
桓玄在左右众将、幕僚陪同下，骑着高头大马进了建康。
先去了宫城，拜见了司马德宗，然后拟定了第一份诏书，内容是诛杀奸党乱臣。
相王司马道子罪名为“酗酒、不孝”等，由侍御史杜林押送，流放江州安成郡（今江西吉安市安福县）。
桓玄命人把司马元显绑于闹市，一条条历数他的罪责后，将他和他的长子司马彦璋以下所有六个儿子，连同谯王司马尚之，谋士张法顺，庾楷等人被判腰斩并弃市。
三月初四，桓玄恢复隆安这个年号。
皇帝司马德安下诏书，命令解除戒严。
然后再下诏任命桓玄统领文武百官，都督中外诸军事、丞相、录尚书事、扬州牧，加授黄钺。
再任命桓伟为荆州刺史，桓谦为尚书左仆射，桓修为徐、青二州刺史，桓石生为江州刺史，卞范之为丹阳尹。
桓玄独揽朝内朝外军政大权，龙亢桓氏在桓温死后二十九年重新走上了东晋朝廷的巅峰。
三月初五，刘牢之心心念念的赏赐下来了，封征东将军、会稽内史，调离京口赴会稽上任。
他原本就是征西将军，江州刺史，前锋都督，现在桓玄竟然给他解除了军权，只是保留了将军封号。
这可是刘牢之万万没想到。
这一晴天霹雳把刘牢之打回了残酷的现实中，他懊悔不已。
王恭看不起他是因为他出身不好，司马元显看不起他是因为他粗鄙武夫，现在桓玄依旧是看不起他！
三人对他的真实态度只有两个字——利用。
而桓玄比王恭、司马元显更加阴险狡诈，十几天前还给自己许愿，信誓旦旦，一占领建康就变了脸。
这些皇亲国戚、高门士族拿他当枪使，东征西讨，打仗时对他好言安抚，不打仗时就弃之不用，这跟对待一条狗有什么两样？
儿子刘敬宣就向刘牢之建议，利用他还尚存的威望和影响力，召集将士进攻丞相府诛杀桓玄。
曾经在战场上勇猛无敌的刘牢之现在已经是雄心不再，犹豫再三，将北府兵从建康城中拉到了外围，新洲西南的班渎，以观望建康形势。
安顿好后，刘牢之单独找来最器重的建武将军刘裕（三年前孙无终把刘裕举荐到刘牢之的北府军参与剿灭天师道）。
这些年来刘裕披坚执锐，打仗冲锋在前，骁勇善战，富有智谋，多次打败人数十几倍的天师道叛军，把孙恩赶回海岛，立下赫赫战功。
刘牢之问刘裕，我打算渡江去广陵，与宁朔将军高雅之合兵共同讨伐桓玄，你愿追随我吗？
没想到刘裕一口回绝了他，“将军以数万劲卒背叛朝廷，倒戈桓玄，如今桓玄大权在握，民众刚刚逃离战火，稳定下来，将军再起兵，不得民心，若将军执意如此，末将宁可解甲归田，回京口种地。”
刘牢之闷闷不乐，再召北府军众将、幕僚商议，宣布自己的决定，要去广陵会合高雅之讨伐桓玄。
众人多数表示不同意，大家的家眷都在京口，如果举兵反叛，那家眷首先会被桓玄杀尽。
刘牢之有了一种四面楚歌的感觉，只得宣布散会，以后再议。
桓玄本来就对手握北府军的刘牢之不放心，更加了解他的为人反复无常，早就重金收买了刘牢之的其中一个幕僚。
刘牢之一散会，他的会议内容马上就传到了桓玄的耳朵里。
于是桓玄也召集了亲信卞范之、殷仲文、桓谦来相府里密议。
大家对刘牢之的节操品行了如指掌，如今朝廷大权和地方主要州郡都在桓氏族人和亲戚手里，怎么可能再放给外人？
丹阳尹卞范之是桓玄深为倚重的心腹，多年前就追随他。
左卫将军、侍中殷仲文虽然是桓玄对头殷仲堪的堂弟，但他还有个身份是桓玄的姐夫。
尚书左仆射桓谦是桓玄叔父，大名鼎鼎的桓冲之子，为人正直，且少有才望，名声远播。
大家坐下后，桓玄开门见山地把自己的意图说了出来，该解决掉刘牢之了，留着他是个心腹大患。
但他手里还有三万北府军，大家也都知道，这三万人都是能征惯战的老兵，战斗力可抵三十万普通兵。
虽然现在刘牢之和麾下众将有些离心离德，但派人下诏去杀刘牢之，万一激起他们哗变呢？
那么东征司马元显一年多来取得这来之不易的胜利果实，会不会因此而不复存在？
桓谦说，此事不宜操之过急，北府军将领在刘牢之麾下十几年了，有他儿子，有他女婿、外甥，还有心腹。
殷仲文说，可否派人召刘牢之入宫，将其斩杀？
桓玄说，不可，现在刘牢之可能已有提防，不会入朝，即便会来，杀了他万一班渎的北府军进攻建康，后果不堪设想。
大家陷入了沉默中，桓玄把期盼的眼神投向了一直默默无语的智囊卞范之。
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