他们利用方尖碑也就是所谓预言者的力量将人类转化为另一种特殊的种族。
这个变异人类种族不但寿命悠长，而且具有各种强悍的神奇能力。
这就是异人族的起源。
之后玛雅时期到来，有一名玛雅族的勇士被克里人的收割者捕获并进行了异人转化试验。
于是一名名为蜂巢的异人就诞生了。
蜂巢的头部似章鱼，如同怪物一样，而且有着可以将意识无限传递并且寄生于他人的能力。
这样的能力非常强大让他能够控制其他异人，像极了神话中的海德拉九头蛇，是不死不灭的存在。
由此他收获了一群忠实的崇拜者。
然而另一部分远古异人族畏惧他的力量，最后利用克里人的科技让蜂巢放逐到了一个遥远的荒凉行星。
为了拯救自己的偶像，蜂巢的崇拜者们成立了九头蛇组织，并且不断的将人类作为食物投放给被放逐到遥远行星飞蜂巢。
这就是九头蛇的起源以及九头蛇这个组织所隐藏的终极秘密。
时间到了二战时期，在野心勃勃的红骷髅的带领下，整个九头蛇组织获得了突飞猛进的提升。
沉迷于北欧神话的约翰史密特在挪威发现了奥丁在古时期藏在这里的宇宙魔方。
于是让他的首席科学家阿尼姆·佐拉着手开发以此为能源的先进而又强大的武器。
得益于对空间宝石的研究，他们的科技水平和武器装备大幅度领先当时同盟军。
结果这位运气不好，碰了能够和宇宙霸主五五开的大·胸翘·臀的美国队长。
整个九头蛇组织因此元气大伤，差一点覆灭。
九头蛇各个部门机构的首领都被逮捕关押起来。
之后九头蛇这个组织就发挥了他们无与伦比的渗透和潜伏能力。
当时的神盾局前身机构也就是战略科学军团，在九头蛇组织的残骸一步一步发展壮大起来。
他们继承了九头蛇组织很多珍贵的知识资源、装备以及科研人员。
但是由此也给了九头蛇东山再起的机会。
九头蛇就这样趁机渗透到了战略科学军团中，摇身一变成了“自己人”。
这就是崛起之后的潜伏时期。
到今天整个神盾局已经可以称为蛇盾局了。
叶翎甚至怀疑只要会说一句“九头蛇万岁”，就可以在神盾局横着走。
九头蛇起源时期的首领为异人蜂巢，崛起时期为红骷髅约翰施密特，潜伏时期的首领就是皮尔斯，也就是神盾局的前任局长。
前两个boss的命运都一样，全部被放逐到了遥远的行星之。
不过当年纵横无敌的蜂巢现在是饥肠辘辘，只能苟延残喘，而红骷髅约翰史密特则成为了灵魂宝石的看门狗。
反倒是皮尔斯混的风生水起，不但过了轻松悠闲的退休生活，而且暗地里还是大权在握。
皮尔斯就是那个卧底卧成帮派老大的狠人，堪称无间道之王。
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