韩爌认为方从哲、刘一燝和自己对李可灼所进之药皆抱怀疑的态度：“诸臣问安毕，先帝即顾皇上，命臣等辅佐为尧、舜。又语及寿宫，臣等以先帝山陵封，则云：“是朕寿宫。”因问有鸿胪官进药。方从哲奏云：“李可灼自谓仙丹，臣等未敢信。”先帝即命传宣。臣等出，移时可灼至，同入诊视，言病源及治法甚合。先帝喜，命速进。臣等复出，令与诸医商榷。刘一燝语臣，其乡两人用此，损益参半。诸臣相视，实未敢明言宜否。”
韩爌又表明当时群臣是反对让先帝连服两丸的：“须臾，先帝趣和药，臣等复同入。可灼调以进，先帝喜曰：“忠臣，忠臣。”臣等出，少顷，中使传圣体服药后暖润舒畅，思进饮膳，诸臣欢跃而退。比申末，可灼出云：“圣上恐药力不继，欲再进一丸。”诸医言不宜骤。乃传趣益急，因再进讫。臣等问再服复何状，答言平善如初。此本日情事也。次日，臣等趋朝，而先帝已于卯刻上宾矣，痛哉！”
韩爌更一步指出像红丸案这样的大案不能光凭臆想，要实事求是：“方先帝召见群臣时，被衮凭几，俨然顾命。皇上焦颜侍侧，臣等环跪彷徨，操药而前，吁天以祷。臣子际此，憾不身代。凡今所谓宜慎宜止者，岂不虑于心，实未出于口，抑且不以萌诸心。念先帝临御虽止旬月，恩膏实被九垓。为臣子者宜何如颂扬，何如纪述。乃礼臣忠愤之激谈，与远迩惊疑之纷议，不知谓当时若何情景，而进药始末实止如此。若不据实详剖，直举非命之凶称，加诸考终之令主，恐先帝在天之灵不无恫怨，皇上终天之念何以为怀。乞涣发纶音，布告中外，俾议法者勿以小疑成大疑，编摹者勿以信史为谤史。“
文震孟建言获谴，韩爌论救甚力。天启三年，天启皇帝以山东平妖贼功，韩爌加少师、太子太师。时叶向高当国，韩爌次之。及杨涟劾魏魏忠贤二十四大罪，魏忠贤颇惧，求援于韩爌。韩爌不应，魏忠贤深衔之。既叶向高罢，韩爌为首辅，每事持正，为善类所倚。然叶向高有智术，笼络群奄，韩爌惟廉直自持，势不能敌。
而同官魏广微又深结魏忠贤，遍引邪党。其冬，魏忠贤假会推事逐赵南星、高攀龙，韩爌急率朱国祯等上言：“陛下一日去两大臣，臣民失望。且中旨径宣，不复到阁，而高攀龙一疏，经臣等拟上者，又复更易，大骇听闻，有伤国体。”魏忠贤益不悦，传旨切责。未几，又逐杨涟、左光斗、陈于廷，朝政大变，魏忠贤势益张。
大明制度，阁中秉笔止首辅一人。魏广微欲分其柄，嘱魏忠贤传旨，谕韩爌同寅协恭，而责次辅毋伴食。韩爌惶惧，即抗疏乞休。略言：“臣备位纶扉，咎愆日积。如诘戎宜先营卫，而观兵禁掖，无能纾宵旰忧。忠直尚稽召还，而榜掠朝堂，无能回震霆怒。后先诸臣之罢斥，谕旨中出之纷更，不能先时深念，有调剂之方，又不能临事执持，为封还之戆。皆臣罪之大者。皇上释此不问，责臣以协恭，责同官以协赞。同官奉诏以从事，臣欲补过无由矣。乞亟褫臣官，为佐理溺职之戒。”
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