当然，拯救大明于危难之中是个系统工程，首先从颁布即位诏开始吧，皇帝诏曰：“我国家列圣，缵承休烈，化隆俗美，累洽重照，远垂万祀。我大行皇帝，仁度涵天，英谟宪古，励精宵旰，锐虑安攘，海宇快睹，维新疆土，勤思恢复，万机总揽，六幕禔休。方启宏图，忽宾龙驭。爰膺顾命，及予眇躬。侧聆凭几之言，凛念承祧之重。文武群臣军民耆老合词劝进，至于再三，辞拒弗获，乃仰遵遗诏，与八月二十四日祗告天地，即皇帝位。
朱由检确定了自己的年号：“以明年为崇祯元年，朕以冲人统承鸿业，祖功宗德，惟祗服于典章吏治民艰，将求宜于变通。毗尔中外文武之贤，赞予股肱耳目之用，光昭旧绪，愈茂新猷。所有合行事宜，开列于后。于戏！际兹景命维新，嘉于更始，鉴于先王成宪，庶永无愆，若乃宣布诏书，俾阻深之咸耀，匡扶不逮，使次第而可行，惟尔百司，与朕一德，播告天下，咸使闻知，天启七年八月二十四日。”
崇祯新皇上位，要做的事情有很多，首先是清理宗室人数，同时允许他们从事四民之业，对于关押在凤阳监狱内的犯罪宗室，视情节从轻发落其次公侯、阁臣、文武官员取消当年的考核，一律留用，仍按旧例发放俸碌，不得受改元影响拖延政务再次，九边军饷依旧例发放。
崇祯皇帝关注民生，又为天下人颁发大红包，首先是给农民解负：“两京十三省免收农业税一年，凡钱粮未交清而家徒四壁的，也令有司查勘后予以减免我朝弊政，除三饷，辽饷之外，复还有练饷、剿饷，数倍加派，近者十余年，远者二十年，以致民不聊生，朝不保夕。更有粮料、召买诸多名目，各种私派巧取殃民。今与民约，凡正额赋外，一切加派尽予删除。官吏若有不从者，察实治其罪。”
其次是加强司法权威：“自嘉靖、万历以来，刁风日竞设机构讼，伤财败俗朕心窃痛之！自今皆予以维新，凡有违谕讦讼者，以所告之罪罪其自身。田、婚、斗殴细故，就有司告理即可。重大案情者经抚按结案，不是机密要情，无许进入京城越级诉讼。有讼师诬陷良民的，加罪一等反坐讼师“
最后是大赦天下，广旋恩泽于官员，工匠，商人“文、武官员凡免职为民的，准予冠带居住冠带居住的则准予致仕赦免除强盗、谋反、亲人之间互相谋杀等十恶不赦大罪之外犯罪因三大殿工程已峻工，不许再摊派工、铺、商、车户夫匠“
魏忠贤不甘失去权柄，试图使用美色拉拢的招数对付崇祯皇帝：一夕，崇祯皇帝与词臣谈论政治。更余未退。崇祯皇帝忽起，命内监秉烛绕行遍阅壁隅，寂无所见。已而，遥见殿角火星微，立命毁壁。入视，见一小内监持香端坐于内。询之，乃魏忠贤所使也。朱由检勤于政事，一闻此香，使欲心顿起耳。崇祯皇帝曰：“吾方静摄，而心忽动，固疑有是。“遂命去之。
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