但琉球接受清帝册封、转投清廷，却使得当时掌握制海权的郑森对其大为仇视，派出海盗大肆劫掠琉球的商船和贡船，琉球的朝贡贸易彻底断绝。
琉球国失去了最主要的经济来源，日益穷困，萨摩藩也逐渐放松了对琉球王的监控。
而此时大兴军却异军突起，短短几年之内便收复了中原，接下来又在朝鲜歼灭鞑子余孽，朝鲜国主上书请求撤藩内附，迁居燕京。
消息传到琉球，琉球王尚质便也动了心思，与其在琉球受尽倭人欺凌，整天提心吊胆，还不如学朝鲜国主向汉王上书请求撤藩内附，迁居燕京过富贵日子。
于是，琉球王派出了王舅马宗毅正议大夫蔡祚隆等人赴京纳贡方物表贺汉王登极并请求撤藩内附。
刘玄初将来龙去脉说了个清清楚楚，末了又道：“此次琉球使团的护卫之中，差不多有一半是倭国萨摩藩派出来的武士，琉球王舅马宗毅正议大夫蔡祚隆好不容易才摆脱他们的监视将这些情况传到内阁，但却没有正式的奏折！”
“这个无关紧要！”李元利脸上笑意盎然，“内阁准备怎么做？”
刘体纯回道：“臣与两位大人商议过了，已经派人去同文馆捉拿倭国萨摩藩武士，然后安排使臣明日入宫来觐见殿下！”
“等大典过后，咱们再派几艘铁甲舰送琉球使臣回去，顺便就将琉球的倭人全都解决了！不过有点麻烦的是，六部这边抽不出人来随同前往！”
大兴军现在不缺武力，但治理地方的文官缺口却越来越大，开年去朝鲜的时候，还将京师大学堂没有毕业的学生都弄了不少出来，现在要想再往琉球派遣官吏，那实在是无能为力。
“实行军管吧……就是由驻军管理，让琉球当地土官协助，反正琉球也没多少人，先应付两三年再说！”说起这事李元利也是恼火，原来是整天想着如何抢地盘，现在地盘大了，却又没人去治理。
现在把琉球收回来，大兴军还得倒贴钱粮。
怪不得万历年萨摩藩入侵琉球之后，福建巡抚丁继嗣在琉球的朝贡物品中发现多种以前未出现过的倭国商品，因而怀疑倭人假冒琉球贡使团，或倭人混入其间、逼迫琉球官员来贡，甚至琉球可能已沦为倭国傀儡。
兵部随后为此展开调查，认定琉球使团内藏倭寇，且琉球已名存实亡，实际控制于倭人之手。然而直到明朝灭亡，朝廷都没有拿出对琉球的处置方法，最大的原因，就是得不偿失。
但在李元利心中，琉球群岛却无比重要。
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